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2000年血腥的除夕夜，仙治（唐泽俊明饰）一行人极力阻止“朋友”们策划人类灭绝的计划，但反抗却以失败告终。 当晚之后，明智派被诬陷为袭击人类的恐怖分子，而“敌人”则公然成为救世主，受到所有人的崇拜和尊重。 2015年，睿智的侄女远藤上野（平爱里 饰）已经成长为特立独行的少女。 她对课本上对叔叔的诽谤非常反感，经常与老师发生争执。 最终，学校决定将她和另一个曾对血腥跨年夜提出疑问的女孩小泉恭子（木南遥 饰）送到“朋友天堂”。 与此同时，一名在“朋友天堂”中变身的异装男子意外得知了“朋友”的秘密，并被警察击毙。 目睹这一幕的神无决定进入“朋友乐园”一探究竟。 另一方面，新一届世界博览会将在日本举办，教皇也将在此时访问日本。 被关押在萤火虫集中营的阿久（丰川悦二饰）越狱，仙治派幸存的战友纷纷聚集。 在这个至暗时刻，人类的命运将再次改写……本片改编自浦泽直树的同名漫画。 （影片介绍中涉及的人物名字均根据中文版原著漫画翻译而来）
